После первого посещения Европы, Петр I заинтересовался анатомией и зоологией, собирал \"натуралии\", которые хранились в Аптекарском приказе в Москве. В 1714 году экспонаты были перевезены в Петербург. Этот год считается годом основания кунсткамеры. Из второй поездки в Европу, император привез коллекцию нидерландского анатома Фредерика Рюйша.
Специально для частной коллекции Петра I, на берегу Невы было построено здание. Строительство завершено в 1734 году, это - одно из самых старых музейных зданий мира. Проектировал его в стиле петровского барокко Георг Маттарнови. Два корпуса по 3 этажа соединены многоярусной башней. Рисунок здания изображен на логотипе Российской Академии наук.
По указу Петра I, в кунсткамеру за плату принимались найденные по всей стране интересные предметы. Постепенно музей из \"кабинета редкостей\" стал этнографическим и антропологическим. В 1724 году в нем открыта Академия наук. В последующие 200 лет коллекции пополнялись специальными академическими экспедициями, путешественниками и мореплавателями.
С самого начала кунсткамера была не только музеем, но и научным центром. В ее крыле находилась Академия наук, в которой работал М.В. Ломоносов. Традиции продолжаются и сегодня. В музее работают отделы археологии, антропологии, этнографии всех континентов мира, выставлены редкие экспонаты и находки.
В башне кунсткамеры была открыта обсерватория Петербургской академии наук. К середине 1730-х годов она стала одной из лучших в Европе, в ней проводились научные исследования. Традиция отмечать полдень выстрелом зародилась в кунсткамере. В нужное время с помощью факелов и зеркал обсерватория давала сигнал для выстрела пушкарям Адмиралтейства.